אוסף האצות, עשבי הים וצמחי המים המתוקים של אוניברסיטת תל אביב הוא הגדול מסוגו בלבנט. האוסף מכיל מעל ל-30,000 פריטי אוסף מתויגים. רובו המכריע מורכב מאצות שנאספו לאורך חופי ישראל וסיני. האוסף נמצא בתחילת תהליך קטלוג ממוחשב שמסתמך בין היתר על קטלוג קיים. בסוף התהליך יהיו הנתונים זמינים למחקרים אקדמיים של אצות מאוניברסיטאות בעולם.

האוסף מחולק לשני אוספים לפי צורת שימור החומר המדעי. אוסף לח, המכיל דגימות שרובן שומרו תחילה בפורמלין ולאחרונה הועברו לכוהל. ואוסף יבש, המכיל אצות ושאר צמחי מים שיובשו והוצמדו לגיליונות נייר. רוב הפריטים באוסף נמצאו ונאספו על ידי ד"ר יעקב לפקין, שייסד את האוסף עוד בשנות השישים של המאה העשרים. תחילה נשמר האוסף באבו-כביר שהיה ביתה הקודם של הפקולטה למדעי החיים. כיום שוכן האוסף במשכנה הנוכחי של האוניברסיטה ברמת אביב. מאז תחילת המילניום החל אוסף האצות ועשבי הים לגדול שוב ונוספו לו אלפי פרטי אוסף חדשים המצביעים בצורה ברורה וחד משמעית על שינויים שחלו בהרכב מיני האצות בחוף הים תיכוני של ישראל. שינויים אלה הם תוצאה של פלישת מינים זרים שמקורם באוקיינוס ההודי והשקט וכן בים סוף. מינים אלה מוצאים תנאים נוחים להתיישבות עקב ההתחממות הגלובלית של מי הים שמאפשרת סביבה אופטימלית לפלישת מינים טרופיים.

אוסף האצות מכיל פרטים מארבע קבוצות והן: כחוליות, ירוקיות, אדומיות וחומיות. אוסף זה גדל בהתמדה בשנים האחרונות ונוספים אליו מינים חדשים לישראל, לים תיכון ואף למדע. אוסף עשבי הים מכיל פרטים רבים שנאספו בים סוף. אוסף צמחי המים המתוקים מכיל דגימות צמחים ממערכת הנאווניתאים וכן דגימות של טחבי מים נדירים מאד. אוספי האצות ועשבי הים משמשים כיום למחקר פיטוגיאוגרפיים העוסק בשינויים הפלוריסטיים שחלו בחופי ישראל. 

אוספים